In oude geschriften komt de naam “Jobbegae” rond 1400 al voor. Het plaatsje lag toen ergens midden in het veengebied. Rond 1700 is de vervening in deze omgeving begonnen. Na de aanleg van de sluis in de Schoterlandse Compagnonsvaart in 1774 heeft de dorpskern zich rond de sluis ontwikkeld, Jubbega 3e sluis.
